مثال بوند الببتيد

ال السندات الببتيد هو الذي فيه يتم ربط جزيئين من الأحماض الأمينية بالتكثيف.

لفهم روابط الببتيد بشكل أفضل ، يجب أولاً تحديد الأحماض الأمينية:

ال الأحماض الأمينية هي جزيئات عضوية باختصار يحتوي على الأقل مجموعة أمينية (-NH₂)القلوية في الطبيعة ، ومجموعة الكربوكسيل (-COOH)، حمضية في الطابع.

على الرغم من أن الكائنات الحية تصنع ، لأغراض مختلفة ، أنواعًا متنوعة جدًا من الأحماض الأمينية ، إلا أن أهمها تلك التي جزء من البروتينات ، وكلها تنتمي إلى فئة الأحماض الأمينية ألفا.

تتميز الأحماض الأمينية ألفا بوجود المجموعات الحمضية والأمينية المرتبطة بذرة الكربون نفسها ، والتي تسمى α Carbon. علاوة على ذلك ، يرتبط هذا الكربون α ، كبديل ثالث ، بذرة الهيدروجين وكرابع البديل ، مجموعة إضافية ذات أحجام وخصائص متنوعة ، والتي تميز كل حمض أميني عن الأخرين.

البديل الرابع يسمى سلسلة جانبية من الأحماض الأمينية وغالبًا ما يتم تمثيلها في شكل مبسط بالحرف R.

نظرًا لاختلاف البدائل الأربعة لكربون ألفا ، وتعتمد ترتيبًا رباعي السطوح حوله ، فإن الأحماض الأمينية ألفا موجودة التماثل البصري، وهو عندما يكون للجزيء نموذج بديل يبدو مثل أ

أنعكاس الصورة له ، والذي في النهاية ليس جزيءًا متساويًا. يتم تخصيص الأحرف D أو L لهذين الشكلين المتماثلين للجزيء ، اعتمادًا على كيفية ترتيب البدائل في الفضاء. جميع الأحماض الأمينية الموجودة في البروتينات هي L.

تصنف الأحماض الأمينية وفقًا لطابعها الكيميائي في القطبية والقطبية. وتنقسم القطبية بدورها إلى محايد ومشحون (والتي يمكن أن تكون حمضية أو قاعدية). ال يمكن أن يكون اللاقطبي أليفاتي أو عطري.

الببتيدات والسندات الببتيدية

الببتيدات هي نتاج الاتحاد التساهمي للأحماض الأمينية من خلال Amide Bonds ، والتي تتشكل بواسطة تكثيف طرف الكربوكسيل لأحدهما والنهاية الأمينية للطرف الآخر ، مما يؤدي إلى إطلاق جزيء ماء في تفاعل. هذا الاتحاد يسمى ببتيد بوند.

يتم عرض آلية هذا التفاعل أدناه ، حيث مجموعات الأمينو والكربوكسيل ، ويحدث تكثف جزيئات الأحماض الأمينية لتكوين الببتيد.

الببتيدات ، مثل الأحماض الأمينية والبروتينات ، لديك مجموعة أمينية ومجموعة كربوكسيل في نهايتها بدون رد فعل.

لتحديد صيغة الببتيد البسيط ، وحتى البروتين ، يكفي سرد ​​الأحماض الأمينية التي يتكون منها ، بدءًا من المجموعة التي تحتوي على مجموعة أمينو مجانية، وتنتهي بمجموعة الكربوكسيل المجانية.

بعض الببتيدات الموجودة في الجسم هي فازوبريسين، مما يرفع ضغط الدم ويزيد من إعادة امتصاص الماء في الكلى ؛ ال إنكيفالين، مما يقلل من الإحساس بالألم. و ال الأوكسيتوسين، مما يؤدي إلى تقلص الرحم.

خصائص رابطة الببتيد

تكثيف المجموعة الأمينية لأحد الأحماض الأمينية مع الكربوكسيل من آخر ، يحدث في مذيب مائي، لهذا السبب انها ليست عفوية، وبالتالي يتطلب تخليق البروتين إمدادًا بالطاقة.

رابطة الببتيد ، كما هو الحال في أي رابطة أميد ، يقدم صدى بين شكلين متطرفين: الشكل المحايد، مع رابطة واحدة تنضم إلى كربون الكربونيل للحمض الأميني الأول والنيتروجين الأميني الثاني (C-N) ، و النموذج مع فصل الرسوم حيث ترتبط الذرات برابطة مزدوجة (C = N). في الواقع ، لا تتبنى رابطة الببتيد أيًا من الحالتين المتطرفتين ، ولكنها مزيج رنان من كليهما.

هناك دعوة طائرة الببتيد، تتكون من جميع الذرات المشاركة في Peptide Bond ، والتي تنضم إلى اثنين من الأحماض الأمينية الأولية. من ناحية ، ذرات النيتروجين والهيدروجين ، مع الكربون α الخاص بكل منهما في الحمض الأميني الأول. من ناحية أخرى ، الكربون α للحمض الأميني الآخر ، مع الأكسجين والكربون لمجموعة كاربونيل.

الاختلافات بين الببتيدات والبروتينات

ال تحتوي الببتيدات على عدد قليل من الأحماض الأمينية، والتي تتراوح من اثنين إلى بضع عشرات منها ، ويصبح تشكيلها في الحل مرنًا.

ال بروتينات صغيرة، قريبًا من الناحية الهيكلية من الببتيدات الكبيرة ، لها أ تعريف التشكل وأقل مرونة بكثير.

هناك بروتينات ، مثل الببتيدات ، لها شكل مضطرب ومرن ، ولكن هذا الترتيب عندما تتفاعل مع الجزيئات الكبيرة الأخرى في الخلية.

20 نموذجًا من الأحماض الأمينية التي تشارك في رابطة الببتيد

1. الوستارية
2. للفتاة
3. فالين
4. يسين
5. إيسولوسين
6. البرولين
7. ميثيونين
8. فينيل ألانين
9. تيروزين
10. تريبتوفان
11. سيرين
12. ثريونين
13. سيستين
14. الهليون
15. الجلوتامين
16. حمض الأسبارتيك
17. حمض الجلوتاميك
18. ليسين
19. أرجينين
20. الهيستيدين